Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnt1O88346 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms