Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stag3O70576 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stag3O70576 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag3O70576 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag3O70576 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag3O70576 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag3O70576 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag3O70576 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag3O70576 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag3O70576 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Stag3O70576 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stag3O70576 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stag3O70576 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stag3O70576 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
Stag3O70576 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stag3O70576 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag3O70576 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms