Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms