Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2a2O55143 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms