Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp26a1O55127 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp26a1O55127 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms