Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc3O55013 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc3O55013 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms