Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom1O54990 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom1O54990 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prom1O54990 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom1O54990 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom1O54990 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom1O54990 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom1O54990 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom1O54990 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom1O54990 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prom1O54990 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms