Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema6bO54951 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema6bO54951 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms