Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfkbieO54910 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NfkbieO54910 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbieO54910 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms