Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh16O54909 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16O54909 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms