Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops5O35864 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops5O35864 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cops5O35864 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops5O35864 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops5O35864 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms