Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Socs1O35716 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs1O35716 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs1O35716 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs1O35716 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs1O35716 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs1O35716 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms