Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pold2O35654 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pold2O35654 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pold2O35654 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms