Protein–RNA interactions for Protein: O35643

Ap1b1, AP-1 complex subunit beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1b1O35643 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap1b1O35643 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1b1O35643 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms