Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebi3O35228 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms