Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grcc10O35127 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Grcc10O35127 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Grcc10O35127 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Grcc10O35127 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Grcc10O35127 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Grcc10O35127 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Grcc10O35127 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Grcc10O35127 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grcc10O35127 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms