Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArxO35085 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArxO35085 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArxO35085 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArxO35085 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArxO35085 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArxO35085 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArxO35085 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArxO35085 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArxO35085 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArxO35085 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArxO35085 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArxO35085 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArxO35085 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ArxO35085 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ArxO35085 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ArxO35085 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ArxO35085 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArxO35085 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArxO35085 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArxO35085 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArxO35085 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArxO35085 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArxO35085 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArxO35085 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArxO35085 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ArxO35085 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArxO35085 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArxO35085 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArxO35085 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArxO35085 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArxO35085 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms