Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LhbO09108 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LhbO09108 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LhbO09108 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LhbO09108 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LhbO09108 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms