Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snap23O09044 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Snap23O09044 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap23O09044 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap23O09044 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap23O09044 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Snap23O09044 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snap23O09044 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snap23O09044 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms