Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms