Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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