Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3424L7N298 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3424L7N298 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3424L7N298 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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