Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20939L7N243 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20939L7N243 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms