Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Speer4dL7N216 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4dL7N216 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4dL7N216 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms