Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms