Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim18J3QNP2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms