Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm20918J3QN17 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm20918J3QN17 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm20918J3QN17 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20918J3QN17 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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