Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20815J3KMI0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm20815J3KMI0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms