Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf4bG5E8Z2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf4bG5E8Z2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms