Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trip12G5E870 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms