Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-1G3UXB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms