Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ScaperF8VQ70 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms