Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LctF8VPT3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms