Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dcdc2bF7BCK0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dcdc2bF7BCK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms