Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngap1F6SEU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngap1F6SEU4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms