Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm340F6RGI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms