Protein–RNA interactions for Protein: E9QA22

Zfp644, Zinc finger protein 644, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp644E9QA22 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zfp644E9QA22 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Zfp644E9QA22 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zfp644E9QA22 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zfp644E9QA22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms