Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3hdm1E9Q9Q2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms