Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtproE9Q612 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtproE9Q612 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtproE9Q612 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtproE9Q612 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtproE9Q612 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtproE9Q612 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtproE9Q612 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtproE9Q612 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtproE9Q612 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtproE9Q612 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtproE9Q612 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms