Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r48E9Q5D8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms