Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms