Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Fndc1E9Q043 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Fndc1E9Q043 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms