Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E430018J23RikE9PZQ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E430018J23RikE9PZQ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms