Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx60E9PZQ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx60E9PZQ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx60E9PZQ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx60E9PZQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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