Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf11E9PZM7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf11E9PZM7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms