Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Chd2E9PZM4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chd2E9PZM4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms