Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim30bE9PVL6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim30bE9PVL6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms