Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim5E9PV98 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim5E9PV98 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms