Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clca3bE9PUL3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms