Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Piezo1E2JF22 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Piezo1E2JF22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Piezo1E2JF22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms